国家西瓜甜瓜中期库成立于2001年，主要负责西瓜甜瓜种质资源收集、鉴定、保存、繁殖更新和分发利用，现收集保存西瓜甜瓜种质资源3000份，包括全部西瓜属植物的4个种、大部分甜瓜属植物的15个种，成为国内西瓜甜瓜种质资源保存类型和数量最多的单位，每年对国内10多家科研、教学和育种等单位提供种质分发利用200份次以上。

       国家西瓜甜瓜中期库建筑面积200平方米，设有种质资源分子鉴定实验室、考种室、种子干燥室等，并拥有种子低温保存库30平方米，主要用于西瓜甜瓜种质资源的中期保存（10-20年），低温保存库设计温度为0±5℃，空气相对湿度为50%左右，种子经塑料瓶密封后置于密集种子柜保存，最多可以保存10000份以上种质，能够满足未来若干年种质保存数量增加的需求。

       为了便于种质资源主要性状的观测，国家西瓜甜瓜中期库制定了西瓜、甜瓜种质资源描述规范和数据标准，并对重要性状制作了多样性彩色图谱；针对西瓜生产中的突出问题，国家西瓜甜瓜中期库持续多年开展了西瓜高抗枯萎病、高抗病毒病种质的筛选和创新工作，为抗性育种提供重要的抗性材料；并利用西瓜基因组重测序信息和永久群体，进行了西瓜高密度遗传连锁图谱构建和重要果实性状紧密连锁分子标记开发研究，以为分子辅助育种提供重要的研究基础。